MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 7694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012943	AGT	2	6	3160687	3160692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_012943	CGG	2	6	3165064	3165069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_012943	TCC	2	6	3165110	3165115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_012943	CGG	2	6	3168498	3168503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_012943	CGG	2	6	3168590	3168595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_012943	CGGGC	2	10	3170561	3170570	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5507	NC_012943	CGG	2	6	3170755	3170760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_012943	TG	3	6	3170767	3170772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_012943	CGA	2	6	3170775	3170780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_012943	AAT	2	6	3172001	3172006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_012943	CAA	2	6	3172040	3172045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_012943	GCAA	2	8	3172796	3172803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_012943	AG	3	6	3173923	3173928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_012943	AGGCG	2	10	3173938	3173947	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5515	NC_012943	GCC	2	6	3173950	3173955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_012943	GCT	2	6	3176058	3176063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_012943	CCA	2	6	3181555	3181560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_012943	CTG	2	6	3181583	3181588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_012943	AAG	2	6	3181606	3181611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_012943	TCG	2	6	3183514	3183519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_012943	AC	3	6	3184592	3184597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_012943	GCCGG	2	10	3187832	3187841	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5523	NC_012943	CTC	2	6	3189187	3189192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_012943	ACCC	2	8	3189214	3189221	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5525	NC_012943	CGG	2	6	3189230	3189235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_012943	CGT	2	6	3189284	3189289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_012943	GCC	2	6	3189300	3189305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_012943	GCA	2	6	3189309	3189314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_012943	CCG	2	6	3189349	3189354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_012943	GCAGG	2	10	3189366	3189375	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5531	NC_012943	GTAACT	2	12	3190222	3190233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5532	NC_012943	GCC	2	6	3190262	3190267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_012943	CG	3	6	3190272	3190277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_012943	GC	3	6	3190301	3190306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_012943	GCA	2	6	3191629	3191634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_012943	GCA	2	6	3191688	3191693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_012943	CCAGC	2	10	3191944	3191953	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5538	NC_012943	GCC	2	6	3192964	3192969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_012943	GTG	2	6	3193009	3193014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_012943	GCG	2	6	3193036	3193041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_012943	CGA	2	6	3193109	3193114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_012943	GGC	2	6	3193130	3193135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_012943	ATCA	2	8	3195640	3195647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_012943	GTC	2	6	3195660	3195665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_012943	CCA	2	6	3195695	3195700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_012943	GGC	2	6	3195742	3195747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_012943	GCC	2	6	3195821	3195826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_012943	TCG	2	6	3195833	3195838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_012943	CCG	2	6	3195870	3195875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_012943	ACC	2	6	3195905	3195910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_012943	CAAG	2	8	3195927	3195934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_012943	GCA	2	6	3195956	3195961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_012943	CGC	2	6	3195974	3195979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_012943	CGC	2	6	3195994	3195999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_012943	GCC	2	6	3196015	3196020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_012943	CGG	2	6	3196624	3196629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_012943	GTT	2	6	3196632	3196637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_012943	GTT	2	6	3196644	3196649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_012943	CAC	2	6	3196653	3196658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_012943	GTC	2	6	3196678	3196683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_012943	G	6	6	3196872	3196877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_012943	GCA	2	6	3196937	3196942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_012943	TA	4	8	3197614	3197621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_012943	ATC	2	6	3197623	3197628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_012943	TCG	2	6	3198059	3198064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_012943	CA	3	6	3198071	3198076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_012943	CAG	2	6	3198090	3198095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_012943	GTA	2	6	3198146	3198151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_012943	CGC	2	6	3198205	3198210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_012943	GCG	2	6	3198221	3198226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_012943	GCAG	2	8	3200545	3200552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_012943	ACT	2	6	3201386	3201391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_012943	ACT	2	6	3201432	3201437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_012943	CGA	2	6	3201443	3201448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_012943	CACC	2	8	3201449	3201456	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5576	NC_012943	GCGAC	2	10	3202251	3202260	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5577	NC_012943	GTCC	2	8	3205461	3205468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5578	NC_012943	GTG	2	6	3205989	3205994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_012943	TGC	2	6	3206035	3206040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_012943	GCG	2	6	3206065	3206070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_012943	TGC	2	6	3206106	3206111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_012943	ACA	2	6	3206150	3206155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_012943	GAG	2	6	3206157	3206162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_012943	CGA	2	6	3206165	3206170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_012943	CGG	2	6	3206699	3206704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_012943	GCAGT	2	10	3207919	3207928	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5587	NC_012943	CGG	2	6	3208743	3208748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_012943	GCC	2	6	3208802	3208807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_012943	TTGT	2	8	3208816	3208823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_012943	GCG	2	6	3208838	3208843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_012943	GCCT	2	8	3208845	3208852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5592	NC_012943	T	6	6	3211474	3211479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_012943	CAC	2	6	3212567	3212572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_012943	CCA	2	6	3213845	3213850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_012943	GTG	2	6	3213873	3213878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_012943	CGT	2	6	3213892	3213897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_012943	CGG	2	6	3213928	3213933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_012943	ACG	2	6	3213934	3213939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_012943	GC	3	6	3213985	3213990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_012943	CGT	2	6	3214055	3214060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_012943	ATG	2	6	3214075	3214080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_012943	TCC	2	6	3214081	3214086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_012943	CGA	2	6	3214220	3214225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_012943	CACC	2	8	3214764	3214771	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5605	NC_012943	TGG	2	6	3214823	3214828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_012943	CT	3	6	3215700	3215705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_012943	ATGGCT	2	12	3215708	3215719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5608	NC_012943	AGT	2	6	3215750	3215755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_012943	GAGGC	2	10	3215865	3215874	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5610	NC_012943	GGC	2	6	3219502	3219507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_012943	GAC	2	6	3219529	3219534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_012943	CAT	2	6	3219561	3219566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_012943	TGC	2	6	3219653	3219658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_012943	CGA	3	9	3219668	3219676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_012943	TTCCG	2	10	3219735	3219744	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5616	NC_012943	GAC	2	6	3221236	3221241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_012943	CA	3	6	3221246	3221251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_012943	ACG	2	6	3221252	3221257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_012943	AATG	2	8	3221310	3221317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_012943	ATC	2	6	3221351	3221356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_012943	CGC	2	6	3221371	3221376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_012943	CAGC	2	8	3223551	3223558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_012943	GCG	2	6	3223560	3223565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_012943	ACA	2	6	3224583	3224588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_012943	CGC	2	6	3228497	3228502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_012943	CG	3	6	3229643	3229648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_012943	GC	3	6	3231307	3231312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_012943	TCC	2	6	3231319	3231324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5629	NC_012943	CGC	2	6	3231340	3231345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5630	NC_012943	CGC	2	6	3232625	3232630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5631	NC_012943	ACAGC	2	10	3232668	3232677	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5632	NC_012943	CGC	2	6	3232711	3232716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5634	NC_012943	TCAAA	2	10	3232976	3232985	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5663	NC_012943	CTC	2	6	3239092	3239097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5751	NC_012943	TCGGT	2	10	3280453	3280462	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5752	NC_012943	GCA	2	6	3281814	3281819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5753	NC_012943	CGG	2	6	3281849	3281854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5755	NC_012943	ACC	2	6	3283947	3283952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5756	NC_012943	GC	3	6	3284053	3284058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5757	NC_012943	GC	3	6	3284078	3284083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5758	NC_012943	GCGG	2	8	3284898	3284905	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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